Seminare der Graduiertenschule

Sommersemester 2018

Machine learning methods for molecular simulations

Dozent

Jürgen Pleiss, Institut für Biochemie und Technische  Biochemie
Niels Hansen, Institut für Technische Thermodynamik und Thermische Verfahrenstechnik

Thema

In den letzten Jahren wurden in zunehmendem Maße Konzepte und Beispiele publiziert, wie molekulardynamische Simulationen und Machine Learning - Methoden integriert werden können, um die Qualität von Vorhersagen zu verbessern. In dem GS SimTech-Seminar wollen wir den aktuellen Stand der Literatur diskutieren und das Potential von ML-Methoden für die MD-Simulation ausloten.

Voraussetzung: Kenntnisse der Grundlage von molekularen Simulationen

Literaturvorschläge werden bei der Vorbesprechung ausgegeben

Sprache

Deutsch oder Englisch
Lehrmaterial: Englisch

Vorbesprechung

23.3.2018, 16:30 Uhr im Seminarraum 0.103, Zentrum für Bioverfahrenstechnik, Allmandring 31

Seminartermine

Wöchentlich, Di 16.30 -18 Uhr (ab 10.4.2018)

Seminarraum 0.103, Zentrum für Bioverfahrenstechnik, Allmandring 31 

SWS

2

Leistungspunkte

3

Anmeldung

Für die Teilnahme ist eine Anmeldung bis zum 23.3.2018 erforderlich. Bitte per e-mail an Jürgen Pleiss (Juergen.Pleiss@itb.uni-stuttgart.de).

"Stochastic and Statistical Topics in Modeling and Simulation - Algorithms for Data Assimilation and Conditional Sampling”

Dozent

Prof. Dr.-Ing. Wolfgang Nowak, Institut für Wasser- und Umweltsystemmodellierung

Thema

Data assimilation is an approach to improve model predictions by keeping models on track with incoming time series of data. This is mostly achieved by sequential application of conditional sampling, or by repeated updating of regression-type estimates. This seminar will cover corresponding computer algorithms and their foundations, e.g.:

  • Random number generation
  • Monte-Carlo sampling
  • Rejection sampling
  • Monte-Carlo Markov Chains
  • Particle filters
  • Bayesian Regression
  • Geostatistical inversion
  • (Ensemble) Kalman Filters
  • (Ensemble) Kalman Smoothers

The presented talks will include algorithms, their foundations and, whenever possible, instructive programming demos. Participants are invited from science, engineering, mathematics, statistics and computer science.

Sprache

Englisch

Seminartermine

Mondays, 11:30, starting on 16 April (startup session) - Seminar room 2 (1.002) at the IWS (PWR 61)

23 April and later: Room 0.015 in SimTech (PWR 5a)

SWS

2

Leistungspunkte

3

Leistungsnachweis

Tutorial talks by participants (30+min), active in-class discussion

"Reduction Methods"

Dozent

Prof. G. Schneider, Prof. B. Haasdonk und Dr. Ashish Bhatt

Thema

The seminar will deal with different reduction methods in the fields of dynamical systems and model reduction. The audience are PhD students in SimTech. The topics are suitable for mathematics as well as the various engineering and natural science fields in SimTech.

Sprache

English

Seminartermine

Block seminar, 2 blocks in the second half of the semester. Possible blocks will be selected from the following:
Fr. 1.6.2018: 9:00-13:00, 14:00-17:30
Fr. 8.6.2018: 14:00-17:30
Fr. 22.6.2018: 9:00-13:00, 14:00-17:30

SWS

2

Leistungspunkte

3

Anmeldung

By Email to ashish.bhatt@mathematik.uni-stuttgart.de
Organizational instructions and list of topics will follows after registration by Email

Kontakt

Barbara Teutsch
 

Barbara Teutsch

Koordination Graduiertenschule, Coach

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